Mulder en Scully hebben samen een niveau van blijvende bekendheid bereikt dat vergelijkbaar is met dat van The X‑Files zelf. Hun chemie vormde een van de meest impactvolle procedurele drama’s op televisie, waardoor een dialoog tussen geloof en wetenschap ontstond die latere series als Lost en The Leftovers zouden voortzetten.
Bovenal vormde David Duchovny’s vertolking van Mulder de ruggengraat van de serie; zijn niet-aflatende zoektocht naar de ‘waarheid’ bracht niet alleen de X-Files voort, maar hield de eenheid ook in stand, te midden van wijdverbreide twijfel van de FBI. Aan het einde van seizoen zeven leek hij onlosmakelijk verbonden met The X-Files.
Vanaf seizoen acht trok Duchovny zich geleidelijk terug uit de serie, waardoor de hit tijdens zijn afwezigheid kon doorgaan. Opmerkelijk genoeg vielen The X-Files niet in de categorie van programma's die zonder hun leiding instorten. Scully van Gillian Anderson bloeide zelfstandig op, en de serie voegde twee nieuwe gezichten toe, wat verder aantoonde dat The X-Files het zonder Mulder konden volhouden.
Dit betekent niet dat de daaropvolgende seizoenen vlekkeloos verliepen. De complicaties kwamen voort uit het feit dat Duchovny en Mulder de banden met de serie niet volledig verbraken. Zelfs toen zijn optredens in seizoen negen afnamen, bleef Mulders schaduw over het verhaal hangen, waardoor het nieuwe ensemble zich niet volledig kon vestigen.
De X-Files floreerden onder het rentmeesterschap van Doggett en Reyes
Terwijl het web van samenzweringen rond Mulder en Scully steeds ingewikkelder en gevaarlijker werd, was de hoeksteen van hun partnerschap hun onwrikbare vertrouwen in elkaar. Datzelfde niveau van vertrouwen opbouwen met een nieuwkomer werd de belangrijkste hindernis voor JohnDoggett, die na de verdwijning van Mulder aan het einde van seizoen7 optrad als Scully's partner.
Doggett verdiende niet alleen zijn plaats als betrouwbare bondgenoot, maar onthulde ook een fris, meeslepend facet van Scully. Hoewel hij het volste vertrouwen in haar oordeel had en vaak met haar gevoel meeging, had hij herhaaldelijk moeite om de bovennatuurlijke aspecten van hun onderzoeken te begrijpen. Dit dwong Scully een ‘Mulder-achtige’ houding aan te nemen en de meer irrationele verklaringen te verdedigen.
Door de gebruikelijke rol van Scully om te draaien, behield TheX-Files zijn delicate mix van twijfel en geloof zonder simpelweg een Mulder-kopie in te voegen. Tegen de tijd dat Mulder en Doggett elkaar eindelijk kruisten, kon Scully oprecht zeggen: 'Agent Doggett is onberispelijk.
Hoewel de rol van Scully verschoof naar een onverklaarbare adviserende rol voor Doggett en zijn nieuwe teamgenoot, Monica Reyes, demonstreerde de serie zijn vermogen om het kernduo van *The X-Files* volledig te herstructureren met behoud van de essentiële geest van het programma.
Doggett en Reyes deelden een vergelijkbare basis van wederzijds vertrouwen, maar bezaten een uitgebreider gedeeld verleden dan Mulder en Scully, waardoor hun voortdurende aanwezigheid net zo belangrijk was als de oorspronkelijke combinatie van *The X-Files*. Bovendien introduceerde Reyes een frisse kijk op het bovennatuurlijke, waardoor de serie levendig bleef aan de vooravond van het laatste seizoen van de oorspronkelijke serie.
Reyes vermeed een binaire benadering van hun onderzoeken. Ze behandelde elke zaak zodra deze zich voordeed, vertrouwend op bewijsmateriaal en instinct, dat af en toe op een paranormale oorzaak wees en op andere momenten niet. Haar ontvankelijkheid dwong Doggett om zijn eigen kijk te verbreden, en hun samenwerking aan de X-Files was een streven zonder ego, persoonlijke agenda's of de noodzaak om een punt te bewijzen.
Op persoonlijk vlak integreerde Scully naadloos in hun chemie, waardoor een trio ontstond dat opmerkelijk goed functioneerde. Deze versie van *The X-Files* had het potentieel om nog vele seizoenen door te gaan, ware het niet dat Mulders periodieke terugkeer het momentum verstoorde en een snelle oplossing van de centrale mytharc van de serie noodzakelijk maakte.
Mulder was niet altijd een aanwinst voor de X-Files
De combinatie van Scully en Doggett bracht onmiddellijk de onprofessionele elementen van de dynamiek tussen Scully en Mulder aan het licht. Scully heeft bijvoorbeeld zeven jaar zonder bureau gezeten, een feit dat Mulder nauwelijks in de gaten had, zelfs niet toen Scully hem erop wees. Daarentegen kostte Doggett slechts een handvol afleveringen om Scully te vragen waar ze zat.
Door Scully te positioneren als de belangrijkste voorstander van het team in de plaats van Mulder, illustreerde de serie ook hoe beide agenten elkaars meer confronterende eigenschappen uitlokten binnen hun specifieke rollen. Scully en Doggett leken echte partners, en hoewel Doggett vaak toegaf aan het oordeel van Scully, leek dit eerder voort te komen uit zijn eigen wil dan dat het aan Scully werd opgelegd, die vaak aan Mulders voortdurende minachting voor het protocol moest voldoen.
In 'Roadrunners', een vroege aflevering van seizoen 8, ging Scully impulsief alleen op zoek naar een aanwijzing, waardoor Doggett niet op de hoogte bleef, om later zijn tussenkomst nodig te hebben om haar te lokaliseren en haar leven te redden. Dit weerspiegelde het exacte gedragspatroon dat Mulder herhaaldelijk vertoonde tijdens de eerste zeven seizoenen van The X-Files; Maar nadat hij deze fout slechts één keer had begaan, verontschuldigde Scully zich bij Doggett en garandeerde dat deze niet meer zou voorkomen.
Het wederzijdse respect en de professionele verstandhouding tussen Scully en Doggett bleken veel gunstiger voor hun onderzoek dan de diepe persoonlijke intimiteit die zich tussen Mulder en Scully ontwikkelde.
Wat de algehele kwaliteit van de serie betreft, zette Mulder's incidentele terugkeer in de seizoenen 8 en 9 de verhalen van Doggett en Reyes feitelijk buitenspel, terwijl The X-Files probeerden een verhaallijn van een heel seizoen in de beperkte momenten te persen dat Mulder op het scherm was. Dit probleem werd vooral duidelijk tijdens de revival-seizoenen, waarin grotendeels voorbij werd gegaan aan de solide basis die de show had gelegd met zijn nieuwere leads.
Doggett is volledig afwezig in de seizoenen 10 en 11 van The X-Files, en Reyes wordt gereduceerd tot een korte cameo waarin ze gedwongen wordt een bondgenootschap te sluiten met de Cigarette Smoking Man - een verhaallijn die haar gevestigde kracht en morele kern ondermijnt. De serie vierde in plaats daarvan de fulltime terugkeer van David Duchovny, ook al had zijn aanwezigheid na zo'n lange scheiding niet langer hetzelfde gewicht als ooit voor The X-Files.
