साइलो सीज़न 3 के लिए प्रमुख ख़राबियाँ। साइलो सीज़न 1 के बाद से, यह माना जाता था कि बाहरी दुनिया जहरीली थी। एलीसन, होलस्टन और बर्नार्ड जैसे कई पात्र साइलो 18 से बाहर निकलने के कुछ ही क्षण बाद मर गए। जूलियट का भी वही हश्र होता अगर उसके सूट पर "अच्छा" हीट टेप नहीं होता। हालाँकि, साइलोसीजन 3 की घटनाओं के बाद, यह आश्चर्य करना कठिन हो गया है कि क्या दूसरी दुनिया वास्तव में मनुष्यों के लिए असुरक्षित है।
साइलो के लोगों से कई चीजों के बारे में झूठ बोला गया है। उनमें से अधिकतर लोग इस बारे में बहुत कम जानते हैं कि बाहर की दुनिया में क्या हुआ। उन्हें बस अपने साइलो के संबंधित सत्तावादी नियमों का पालन करने के लिए मजबूर किया जाता है और संस्थापकों के इरादों पर कभी सवाल नहीं उठाया जाता है। हालाँकि, जूलियट जैसे चरित्रों ने दूसरों को यह सोचने के लिए प्रोत्साहित किया है कि क्या साइलो का निर्माण मानवता को बनाए रखने के लिए किया गया था या पूरी तरह से किसी और चीज़ के लिए।
साइलो सीज़न 3 के अंतिम क्षणों में, केमिली जैसे पात्र भी यह महसूस करने के बाद पक्ष बदल लेते हैं कि संस्थापकों को उनकी भलाई की कोई परवाह नहीं है। सीज़न में सूक्ष्म घटनाक्रम और साइलो 1 के आसपास के खुलासे यह भी संकेत देते हैं कि बाहरी दुनिया और केंद्रीय सर्वनाश के बारे में और भी बहुत कुछ है जो नज़र आता है।
बाहरी सुरक्षा उपायों पर साइलो 1 की निर्भरता यह संकेत देती है कि बाहरी दुनिया सुरक्षित है

साइलोसीज़न 2 ने पूरी तरह से खुलासा नहीं किया कि साइलो 17 के लोगों के साथ क्या हुआ। सौभाग्य से, सीज़न 3 उत्तर प्रदान करता है। इसमें एक अनुक्रम दिखाया गया है जिसमें साइलो के लोग अपने भूमिगत बंकर को छोड़ देते हैं और पूरी तरह से ठीक लगते हैं। यदि बाहर की दुनिया जहरीली थी, तो उनमें से अधिकांश को जाने के कुछ ही क्षण बाद मर जाना चाहिए था।
डैनियल/ट्रॉय साइलो 1 से उन पर नज़र रखता है और ड्रोन का उपयोग करके उन पर खुलेआम गोलीबारी करके उन सभी को मारने का फैसला करता है। इससे यह आश्चर्य करना मुश्किल हो जाता है कि अगर बाहर की हवा इंसानों के लिए जहरीली थी तो वह ड्रोन के जरिए उन्हें मारने की जहमत क्यों उठाएगा। क्या अंततः वे सभी मर नहीं जायेंगे?
शिर्ले और नॉक्स साइलो 18 में सेफगार्ड पाइप को सील करने में कामयाब होने के बाद भी, डैनियल साइलो 1 के कर्मचारियों को साइलो 18 के ऊपर ड्रोन रखने का आदेश देता है। वह एक "बाहरी सेफगार्ड" की मांग करता है जो साइलो 18 से बाहर निकलने वाले किसी भी व्यक्ति को मार देगा। यह भी, बाहरी दुनिया के बारे में वही सवाल उठाता है। यदि साइलो से बाहर निकलने वाले किसी भी तरह मरने के लिए अभिशप्त थे, तो ट्रॉय उन पर हमला करने का प्रयास क्यों करेगा?
यह निष्कर्ष निकालना सुरक्षित लगता है कि बाहरी दुनिया सुरक्षित है।
साइलो की पिछली समयरेखा वर्तमान घटनाओं से सदियों पहले सामने आती है। इसके कारण, भले ही दुनिया परमाणु बमों से नष्ट हो गई हो, यह समझ में आता है कि यह वर्तमान में ठीक हो गई है। यह समझाएगा कि दुनिया अब जहरीली क्यों नहीं है, और संस्थापकों के कुछ गुप्त उद्देश्य हैं जो अज्ञात बने हुए हैं।
यदि बाहरी दुनिया सुरक्षित है, तो लोग अभी भी साइलो में कैद क्यों हैं?

साइलोसीज़न 3 की घटनाओं के बाद, यह सवाल करना मुश्किल है कि क्या संपूर्ण साइलो प्रोजेक्ट किसी प्रकार का एक बड़ा धोखा था। यह शो फॉलआउट के समान रास्ते पर चल सकता है, जहां भूमिगत बंकर किसी बड़े प्रयोग या साजिश का हिस्सा हैं। या, एक और संभावना यह है कि पिछली समयरेखा में व्यापक सर्वनाश एक अंदरूनी काम था।
स्टेंसन और सीनेटर थुरमन जैसे चरित्रों ने यह सुनिश्चित करने के लिए यह योजना बनाई होगी कि कोई भी नैनोटेक दौड़ में अमेरिका से आगे न निकल जाए। हालाँकि, यह अभी भी स्पष्ट नहीं करता है कि वे इतनी आसानी से पूरे साइलो से छुटकारा पाने के इच्छुक क्यों हैं। यदि उनका अंतिम लक्ष्य पृथ्वी को फिर से आबाद करना और मानवता को बनाए रखना था, तो उन्होंने एक बार में हजारों लोगों से छुटकारा पाने के लिए प्रत्येक साइलो में सुरक्षा प्रक्रियाएं क्यों स्थापित कीं?
साइलो सीज़न 3 में बहुत सारे नए विकास इस बात पर प्रकाश डालते हैं कि कैसे साइलो का निर्माण करते समय संस्थापकों के मन में अच्छे इरादे नहीं थे। डैनियल और चार्लोट जैसे पात्र निर्दोष थे, लेकिन उन्हें अन्य संस्थापकों की तरह दुष्ट और अनैतिक बनाने के लिए उन पर स्मृति-मिटाने वाली दवाओं का इस्तेमाल किया गया था। चूँकि सीज़न 4 ऐप्पल टीवी श्रृंखला की अंतिम किस्त के रूप में काम करेगा, यह सीज़न 3 द्वारा छोड़े गए सभी रहस्यों को सुलझाएगा।